因为杨嗣昌的进谏，朱由检没有通过枢密院提出的迁徙京城卫所方案。
他在二月二十八日，举行枢密院、兵部、五军都督府联席会议，专门商讨这件事情。
由于杨嗣昌已经在皇帝面前大胆说出实情，皇帝对卫所糜烂的现状也没有多加责怪。担任京营护军使的李邦华在受到皇帝斥责后痛定思痛，大胆陈述京城卫所情况，并认为很多在卫所吃饭的冗员，完全可以裁去：
“京师七十二卫，每卫吏役以三四十名计，合之以二千余人计。”
“此辈空耗粮饷，臣以为每卫留二到四人即可，余者皆可裁去。”
朱由检根本不知这件事情，仔细询问他道：
“这些吏役都是做什么的？”
“为何可以裁去？”
李邦华道：
“他们主要负责文移等事，各卫职守不繁、文移极少，留着他们空耗钱粮而已。”
这是李邦华的看法，朱由检听到之后，却是皱眉说道：
“卫所官兵调动，还有军户的服役、迁徙，怎么能说职守不繁呢？”
“现在卫所的名册，是由谁在管理？”
李邦华支支吾吾道：